然而，随着研究的深入，林雨晴的祖先发现这种物质不仅能够影响时间，还能够引起空间的扭曲，甚至触及到平行世界的存在。为了防止这种力量落入邪恶之手，他创造了一系列的机关和密码，只有真正的继承人才能解开。
陈默和林雨晴意识到，这个秘密远比他们想象的要重大。他们必须在午夜钟声再次响起之前找到解开机关的方法，否则这个力量可能会失控，造成无法预料的后果。
在他们继续研究的过程中，庄园内的异常现象越来越频繁，仿佛有某种力量在抗拒他们的探索。陈默决定利用自己的机械知识，尝试解读装置中的符号和图表，而林雨晴则试图从家谱中找到解开机关的线索。
随着时间的推移，他们逐渐揭开了一部分秘密，但同时也意识到，他们并不是唯一知道这个秘密的人。在他们的周围，可能还有其他人在暗中观察，等待着时机。陈默和林雨晴必须加快脚步，抢在别人之前解开这个谜团。
随着夜色的加深，陈默和林雨晴的调查也逐渐进入了白热化阶段。他们在密室中发现了一扇隐藏的暗门，门后是一间布满灰尘的控制室。室内布满了各种古老的仪器和闪烁的指示灯，墙上挂着一幅幅复杂的电路图和计算公式。
在这间控制室中，他们遇到了赵云天，一位看似年迈却眼神锐利的科学家。赵云天透露，他已经观察了他们一段时间，并决定出面帮助他们。他解释说，这个时钟装置实际上是一个由林雨晴的祖先设计的时空实验装置，目的是探索时间旅行的可能性。
赵云天告诉他们，他曾是林雨晴祖先的同事，一直在暗中保护着这个秘密。但现在有人知道了这个秘密，企图利用装置的力量进行非法的时间旅行，这可能会导致时空崩溃。他警告陈默和林雨晴，如果不阻止这一切，后果将不堪设想。
三人决定联手行动，他们利用赵云天的知识和技术，开始破解控制室中的仪器。随着他们的努力，装置的核心部分逐渐被解锁，但他们也发现了一个惊人的事实：原来有一个犯罪组织早已潜入庄园，他们一直在寻找机会窃取这个秘密。
在一次偶然的机会中，陈默发现了一个隐藏的摄像头，这意味着他们的一举一动都可能被监视着。他们必须小心行事，同时加快速度，赶在犯罪组织采取行动之前，彻底摧毁或控制这个装置。
随着时间的紧迫性增加，陈默、林雨晴和赵云天之间的信任也在不断加深。他们知道，只有团结一致，才有可能战胜潜藏在暗处的敌人，保护这个关乎整个世界安全的秘密。
在赵云天的指引下，陈默和林雨晴开始了解控制室中的每一台机器和每一个开关的作用。他们发现，要彻底关闭这个装置，必须同步启动多个系统，并在精确的时间内输入正确的代码。这是一项艰巨的任务，需要极高的精确度和默契配合。
就在他们准备启动最后的程序时，犯罪组织的人突然出现在控制室门口。一场紧张的对峙开始了，陈默和林雨晴在赵云天的掩护下，争分夺秒地完成最后的设置。赵云天利用自己对装置的了解，制造了混乱，让敌人无法找到关键的操作点。
在一阵混战中，陈默巧妙地利用了装置产生的时空扭曲效应，使敌人的行动变得迟缓和混乱。林雨晴则在关键时刻输入了最后的代码。随着最后一个按钮被按下，整个装置发出了震耳欲聋的声音，然后突然安静下来。
控制室的屏幕上显示出了一系列复杂的图形，表明时空已经回到了正常的轨迹。犯罪组织的人员因为时空扭曲的影响而无法适应，纷纷逃离了现场。陈默、林雨晴和赵云天紧紧地握着彼此的手，松了一口气。
随着装置的关闭，庄园恢复了往日的宁静。林雨晴决定将这个秘密永远封存，不再让它成为危害世界的工具。陈默和赵云天也表示同意，他们知道有些力量是人类不应轻易触碰的。
故事以三人站在庄园的庭院中，仰望星空的场景作为结尾。他们的脸上带着释然的微笑，心中充满了对未来的希望和对过去的敬畏。时间的河流继续向前流淌，而这段冒险将成为他们心中永远的记忆。