小智一行人继续着他们的旅行，这一天，一行人来到了一处港口。
在战胜了一个路人的蓝鳄之后，小智见到了小刚的叉字蝠，叉字蝠是来叫小智，他们要坐的船马上就要开了。
好在最后及时赶上。
小刚和一个叫做怀特的男人一起，把小智拉上了船。
途中，众人聊着天。
“喔，小智的梦想是成为宝可梦大师啊，在这条河的上游，我的村子附近的森林里，有很多宝可梦呢，我的村子叫做果野村。”怀特道。
“真的吗，我想去。”小智道。
“没问题，到前面下了船之后，就改乘我的船吧。”
“皮卡！”
突然，皮卡丘大叫一声。
众人连忙向着皮卡丘指着的那个方向望过去，正是水君。
但是水君很快就离开了。
“那是水君吧，我们真走运啊，一开始就看到了这么稀有的宝可梦。”小刚道。
“水君，是北风的化身，摄影师凤王的小弟之一，拥有净化污水的能力，传说有水君出现的地方，就会刮起北风。”小智道。
见到水君，小智也是想起了这里是什么地方跟什么剧情。
下了船之后，小智连忙找到当地的宝可梦中心，联络到大木博士，替换了宝可梦。
让我们先跟随摄影师凤王的镜头，先将视线转到四十年前。
在果野村附近的一片古老的森林里，一只黑鲁加和一只飞天螳螂正在奉命追捕着一只时拉比。
时拉比快速地飞着，不断在大树的间隙穿过，同时不断地躲避飞天螳螂的劈开绝招和黑鲁加的咬碎绝招，形势非常危急。
与此同时，森林的外部，一位名叫雪成的少年，正打算进入森林里面。
这时，一位挎着挎篮的绿发女生拦住了雪成的脚步，说道，
“先别进去森林里面，如果听到森林的声音，不可以乱动，这是村里的传说。”
“森林的声音？那是什么？”
“有时能听到一个不可思议的声音，据说那是森林的守护神穿越时空时所发出的声音。”
“穿越时空？”
“没错，森林的守护神好像有穿越时空的能力，为了避免被卷入而被带到其他时代，如果听到森林的声音，你不要乱动，知道了吗。”
“好，我知道了，我进去了。”
“诶，等一下。”
女生叫住了雪成，然后从自己挎着的篮子里拿出一个用树叶包着的面包，送给了雪成。
“给，收下这个吧，这个是我自己做的面包，里面有很多森林的树果。”
“非常谢谢你。”
雪成把面包放到背包里，然后走进了森林。
与此同时，森林里面，时拉比被飞天螳螂和黑鲁加追杀着，渐渐体力不支，被飞天螳螂的劈开和黑鲁加的喷射火焰命中，倒在地上，奄奄一息。
此时，飞天螳螂和黑鲁加的主人，一名宝可梦猎人也开着摩托车赶到。